En una primera oportunidad, la Universidad Santo Tomás fue Acreditada Institucionalmente, por la Comisión Nacional de Acreditación de Pregrado (CNAP), en las áreas de Gestión Institucional y Docencia Conducente a Título, desde diciembre del 2005 hasta diciembre del 2007.

Posteriormente, fue re acreditada Institucionalmente por la Comisión Nacional de Acreditación (CNA) en las áreas de Gestión Institucional y Docencia de Pregrado, desde diciembre del 2007 hasta diciembre del 2011.

Actualmente, la Universidad Santo Tomás ha renovado su acreditación por tres años ante la Comisión Nacional de Acreditación (CNA) en las áreas de Gestión Institucional y Docencia de Pregrado, desde diciembre del 2011 hasta diciembre del 2014.

Carreras Acreditadas Universidad Santo Tomás

CARRERA	ÁREA	PERÍODO	AÑOS	SEDE y JORNADA	AGENCIA ACREDITADORA
Ingeniería Comercial	Administración	Desde septiembre de 2011 hasta septiembre de 2014	3 años	Iquique (Vespertina), Antofagasta (Diurna y Vespertina), La Serena (Diurna), Viña del Mar (Diurna), Santiago (Diurna y Vespertina), Concepción (Diurna), Los Ángeles (Diurna), Temuco (Diurna), Valdivia (Vespertina), Puerto Montt (Diurna).
Psicología	Ciencias Sociales	Desde septiembre de 2011 hasta septiembre de 2013	2 años	Arica (Diurna y Vespertina), Iquique (Diurna y Vespertina), Antofagasta (Diurna), Copiapó (Diurna), La Serena (Diurna) , Viña del Mar (Diurna y Vespertina), Santiago (Diurna y Vespertina), Talca (Diurna), Concepción (Diurna), Los Ángeles (Diurna), Temuco (Diurna y Vespertina), Valdivia (Vespertina), Osorno (Diurna) y Puerto Montt (Diurna).
Medicina Veterinaria	Recursos Naturales y Medicina Veterinaria	Desde agosto de 2011 hasta agosto de 2014	3 años	Viña del Mar (Diurna), Santiago (Diurna), Talca (Diurna), Concepción (Diurna), Temuco (Diurna) y Puerto Montt (Diurna).
Educación Parvularia	Educación	Desde diciembre de 2009 hasta diciembre de 2012	3 años	En todas las sedes.
Educación Básica	Educación	Desde diciembre de 2009 hasta diciembre de 2012	3 años	En todas las sedes.
Educación Diferencial	Educación	Desde diciembre de 2009 hasta diciembre de 2012	3 años	En todas las sedes.
Pedagogía en Educación Física	Educación	Desde diciembre de 2009 hasta diciembre de 2012	3 años	En todas las sedes.
Pedagogía en Inglés	Educación	Desde diciembre de 2009 hasta diciembre de 2012	3 años	En todas las sedes.
Enfermería	Salud	Desde noviembre de 2010 hasta noviembre de 2013	3 años	Arica (Diurna), Iquique (Diurna), Antofagasta (Diurna), Copiapó (Diurna),  La Serena (Diurna), Viña del Mar (Diurna), Santiago (Diurna), Talca (Diurna), Concepción (Diurna), Los Ángeles (Diurna), Temuco (Diurna) , Valdivia (Diurna), Osorno (Diurna) y Puerto Montt (Diurna).
Kinesiología	Salud	Desde noviembre de 2010 hasta noviembre de 2013	3 años	Arica (Diurna), Iquique (Diurna), Antofagasta (Diurna), Copiapó (Diurna), La Serena (Diurna), Viña del Mar(Diurna), Santiago (Diurna), Talca (Diurna), Concepción (Diurna), Los Ángeles (Diurna), Temuco (Diurna), Valdivia (Diurna), Osorno (Diurna) y Puerto Montt (Diurna).
Nutrición y Dietética	Salud	Desde noviembre de 2010 hasta noviembre de 2013	3 años	Iquique (Diurna), Antofagasta (Diurna), Viña del Mar (Diurna), Santiago (Diurna), Los Ángeles (Diurna), Temuco (Diurna), Valdivia (Diurna) y Puerto Montt (Diurna).
Tecnología Médica	Salud	Desde noviembre de 2010 hasta noviembre de 2013	3 años	Antofagasta (Diurna),  Viña del Mar (Diurna),  Santiago (Diurna) y Temuco (Diurna).
Contador Público y Audito	Administración	Desde diciembre de 2011 hasta diciembre de 2015	4 años	Santiago (Diurna y Vespertina).
Trabajo Social	Ciencias Sociales	Desde diciembre de 2011 hasta diciembre de 2014	3 años	Arica (Vespertina), La Serena (Diurna), Viña del Mar (Diurna y  Vespertina), Santiago (Diurna  y Vespertina), Talca (Diurna), Concepción (Diurna)y Los Ángeles (Diurna).
Periodismo	Comunicaciones	Desde diciembre de 2011 hasta diciembre de 2013	2 años	Santiago (Diurna).